Dziś (chyba) pojawił się na BoincStats:
DrugDiscovery@Home
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/index.php (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/index.php)
CytatDrugDiscovery@Home is in an early alpha phase and does not have a formal relationship with academia or the pharmaceutical industry.
Zobaczymy, czy coś z niego będzie.
Na razie brak zapisów (ew. tylko z invitation code)
Mchl załóż drużynkę i poproś o invitki dla nas :D ja bardzo chętnie wezmę udział w tym projekcie :D
Ja też bym chętnie doładował ten projekt.
I w obecnej fazie pobawił się w testera.
Team się sam założył (błogosławione automaty, albowiem one władzę nad nami przejmą)
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/team_display.php?teamid=103
Zobaczę czy da się coś w sprawie zaproszeń uzyskać.
Dziwne, bo mój się nie założył - też mam boinc wide drużynkę, na potrzeby wbijania do projektów, gdzie jest invite potrzebny %)
Za tym projektem z tego co wiem stoi Jack Shultz, ten od Hydrogena.
Wyproście go :)
i jak z invitkami??? Da się coś z tym zrobić?? projekt fajny i przydałoby się naczesać punktów
1) RmvBusterS.pl 525 28.53 Poland
2) AL ADIM 74 7.18 Poland
tych dwóch userów najwyraźniej dostało invit code. Podzielcie się chłopaki z nami. Naprawdę chciałbym brać w tym udział.
Ciekawe, jak to AL robi. Jeśli mnie pamięć nie myli też udało mu się dostać invi-cod w innych starszych projektach (niektóre już zakończone).
Też jestem chętny jakby kto miał.
A ja dziś dostałe :D wraz z zakazem dzielenia się :(
ale mozecie bombardować kolesia mailami
Andrey Voronkov - av(małpiszon)drugdiscoveryathome(kropa)com
mi odpisał w przeciągu 24h :D
ale z was napalency :)
i to przy kazdym nowym projekcie, ideowcy :P
Wysłałem prośbę o invitation code. Zobaczymy z jakim skutkiem.
Cytat: Thomas_waw w 08 Lipiec 2009, 10:20
ale z was napalency :)
i to przy kazdym nowym projekcie, ideowcy :P
Różnimy się bardzo i w tym siła naszego zespołu.
Jedną z największych zalet naszego zespołu jest to że bierzemy udział w różnych projektach.
no tak... zgadzam sie
ale to przy kazdym infie o projekcie chcecie byc pierwsi przy "złobie" :)
czasami nawet nie wiadomo czego ma projekt nawet dotyczyc :)
Każdy kiedyś zaczynał :D
Invitation code (but please keep it confidential) dostałem. Podpięty.
Wysłałem prośbę o InvCode...
A jak to się robi? :book:
na maila :D
Dostałem kilka próbek na Cuda. Wywaliło błąd. Na razie dałem na wstrzymanie.
(Język polski literacki górą XD)
Dostałem kod do tego projektu i parę wu nakręciłem. Miałem wrażenie jakbym był w Hydrogenie. Tak samo krótkie próbki, takie samo cheatowanie czasem i ten sam problem na 91,6666% (to z 11/12). Jest trochę lepiej, bo nie wchodzi w śmierć kliniczną. Punkty lepsze od WCG, ale 3x gorsze od paru innych projektów CPU, tak na poziomie Enigmy. Projekt raczej dla fanów. Jakby ktoś bardzo chciał to odstąpię kod.
Cytat: 7NBI_Zarecki Robert w 28 Wrzesień 2009, 14:29
Miałem wrażenie jakbym był w Hydrogenie.
Ta sama ekipa stoi za projektem %)
Cytat: 7NBI_Zarecki Robert w 28 Wrzesień 2009, 14:29
Dostałem kod do tego projektu i parę wu nakręciłem. Miałem wrażenie jakbym był w Hydrogenie. Tak samo krótkie próbki, takie samo cheatowanie czasem i ten sam problem na 91,6666% (to z 11/12). Jest trochę lepiej, bo nie wchodzi w śmierć kliniczną. Punkty lepsze od WCG, ale 3x gorsze od paru innych projektów CPU, tak na poziomie Enigmy. Projekt raczej dla fanów. Jakby ktoś bardzo chciał to odstąpię kod.
ja jestem chętny na kodzik na PM
takie pytanie
Jak przylaczyc sie do projektu ktory nie jest obslugiwany przez Boincstats na kompie ktory jest kontrolowany przez BAM ?
--> Menu "zaawansowane" w managerze
--> "przyłącz się do projektu"
--> dalej według wskazówek
chyba w kompie dopiętym do BAM ta opcja jest nieaktywna
może to zależy od wersji managera?
u mnie na 6.5.0 jest aktywna
ja mam 6.6.. fakt jest tam ta opcja, tylko nalezy podac link/adres do projektu z palca
PS: ktos moze ma jakis invite code do DD@h ? :)
musisz napisać do admina projektu.
hmm na tak ten projekt to tego samego co Hydrogene :P wiec i problem w stylu 99,116% tez jest.
Czekac czy cancelowac te unity ?
mnie sie wszystkie w koncu ukonczyly :D szwankuje estymacja czasu czasami :D
A ja właśnie mam tak:
Ściągnęło się ogółem ze 100 próbek (maks. jest 50, ale na bieżąco dociągały się kolejne). Próbki liczyły się od 5 sekund do 1,5 minuty. Próbki te w zasadzie w cale nie obciążały procesora - w Menedżerze zadań było cały czas 0 w kolumnie CPU i 0 czasu procka. Próbki normalnie były zgłaszane. Po zgłoszeniu na liście zadań mam np. "Run time: 45 sekund, CPU time 5,89 sekundy". W zasadzie wszystkie próbki mają CPU time od 5,5 do 7,5 sekundy (obojętnie, czy liczyły się minutę, czy 10 sekund). Claimed credit za każdą próbkę: 0,03 sekundy.
I zastanawiam się, o co chodzi. Przecież to nie jest projekt non-CPU - projekty te chodzą sobie od pół godziny, a procesor obciążony jest na 10% zadaniami systemowymi. Trochę to bez sensu tak marnować grzałkę.
Ktoś jeszcze tak miał?
Póki co wyłączyłem pobieranie próbek - pewnie znowu będzie dłuuugi przestój, ale ja nie chcę marnować procesora na takie dziwne procesy.
hm...... wygląda na to że coś z aplikacją jest skopane.
w drugdiscovery uruchomiono aplikacje na CUDA i ATI :D
Mdrun ATI OPENCL
Platform Version Installation time
Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 0.02 (ati_opencl) 9 Nov 2010 4:59:25 UTC
MDRUN CUDA OPENCL
Platform Version Installation time
Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 0.02 (cuda_opencl) 9 Nov 2010 4:59:25 UTC
mdrun with cuda
Platform Version Installation time
Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 0.13 (cuda23) 8 Nov 2010 0:26:50 UTC
Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 0.31 (cuda) 22 Mar 2010 12:35:06 UTC
Linux running on an Intel x86-compatible CPU 1.24 (cuda) 22 Mar 2010 12:35:06 UTC
Linux running on an Intel x86-compatible CPU 1.34 (cuda23)
:attack: :attack: :attack: :attack:
mdrun with cuda
Platforma Version Zainstalowano
Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 0.13 (cuda23) 8 Nov 2010 0:26:50 UTC
Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 0.31 (cuda) 22 Mar 2010 12:35:06 UTC
Linux running on an Intel x86-compatible CPU 1.24 (cuda) 22 Mar 2010 12:35:06 UTC
Linux running on an Intel x86-compatible CPU 1.34 (cuda23) 22 Mar 2010 12:35:06 UTC
ubiegłem cię :D
Cytat: Troll81 w 09 Listopad 2010, 15:52
ubiegłem cię :D
Fakt, ale tylko dlatego, że musiałem wpis zmienić :)
BTW temat na newsa?
Zrobione :)
ogromny szacun!!! :parrrty: :respect:
Ostatnio nie mogę trafić sobie palcem do tyłka - tyle mam roboty...
CUDA to oni mieli wcześniej (22 marzec ) :D od dziś jest opencl czyli ATI :D
Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 0.13 (cuda23) 8 Nov 2010 0:26:50 UTC
Naprawdę?
Tak na prawdę, to wczoraj weszli na CUDA2.3...
CytatMicrosoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 0.31 (cuda) 22 Mar 2010 12:35:06 UTC
Linux running on an Intel x86-compatible CPU 1.24 (cuda) 22 Mar 2010 12:35:06 UTC
to ze dali app to jedno
a czy wu sa do tego to drugie :)
Ap jest dopiero od dziś :D daj im trochę czasu :D
spoko
ale kojarze jakies projekty co tez tak mialy a probki na GPU nigdy sie nie doczekalem :
no ja się doczekałem i w picevolver i w paru innych :D po prostu mały sens liczenia tam.... cieszę się że nareszcie jakiś białkowiec BOINC jest na ATI :D
dajcie znać, jak tylko się pojawią jakieś WU, to przełączę co mogę tam - będę teraz wszędzi liczył "ideowo" :parrrty:
Super, tylko coś próbek nie ma. Dołączyłem do projektu, to mi pobrało jedną próbkę CPU, ale co to wyprawia, to masakra. python, cygwin, wszystko się w próbce unzipuje przez wrapper, a potem wrapper odpala coś, śpi ileś tam i potem dopiero włącza kolejne coś...
Szkoda, że projekt nie ma jakiegoś uniwersyteckiego zaplecza, tak przynajmniej piszą, że nie mają.
ja tam czekam, zaznaczyłem by nie pobierało próbek CPU :D
Ale zaszaleli <- już nie co ssać :(
Wracam do CC
Niby rzucili 9,228 próbek, ale na GPU dalej nie mogę nic dostać. ::)
U mnie to samo:
2010-11-12 22:34:10 | DrugDiscovery | Requesting new tasks for NVIDIA GPU
2010-11-12 22:34:12 | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 0 new tasks
2010-11-12 22:34:12 | DrugDiscovery | Message from DrugDiscovery: No work sent
Narazie 100% load na Folding@home ;D
Cytat: apohawk w 12 Listopad 2010, 22:24
Niby rzucili 9,228 próbek, ale na GPU dalej nie mogę nic dostać. ::)
Tia rzucili, ale w 10 minut tego nie było :D
Nie wiem jaki maja refresh, ale server status caly czas podaje (12 Nov 2010 22:24:03 UTC ):
Results ready to send 9,184
Moze to only CPU ?
Na to wygląda :( Refresh mają dobry, 9380 próbek do pobrania.
Czy zadziałała aplikacja licząca na gpu? Postanowiłem odkopać ten wątek, ponieważ projekt wydaje się być niezwykle interesującym i pożytecznym.
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/apps.php
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=236 jak na razie wciaż zonki mają chyba
Czyli w najbliższej przyszłości nie ma szans na białkowiec dla Ati?
przynajmniej mnie takie słuchy nie doszły. MOżna F@H mielić na ATI ale słabo to wygląda....
Zajrzałem na stronę projektu by upewnić się, czy nie wnioskować o przeniesienie tego wątku do projektów nieaktywnych.
Stan jest taki, że administator sporadycznie daje jeszcze oznaki życia, ale obecnie nie generują nowych jednostek i do liczenia projekt jest nieaktywny.
Póki co jeszcze coś tam dają - więc poczekamy.
A jednak chyba trochę to działa:
(http://pl.boincstats.com/charts/chart_pl_drugd_project_new_credits.gif)
Ja czasami coś dostaję - ostatnio chyba 2 dni temu jedną małą próbkę za kilka pkt
Ufff, znalazłem ten wątek...
Dobra Panowie, odkopuję bo projekt będzie reaktywowany, a za serwer będę odpowiedzialny ja i Goofyx :)
Obecnie serwer w sumie już stoi (ale nie jest udostępniony publiczności), zaś my kończymy pracę nad przystosowaniem aplikacji Autodock pod BOINC. Na tę chwilę spodziewamy się aplikacji dla CPU i CUDA. W odróżnieniu od apki w dawnym projekcie, ta będzie działać natywnie z BOINC.
W dalszym czasie dojdzie aplikacja GROMACS, jeżeli nie polegnę przy dostosowaniu jej do potrzeb BOINC.
A nie odkrywasz czasem kola na nowo? Wydaje mi sie ze sa projekty ktore uzywaly autodocka w BOINCu (find@home mi sie kojarzy), moze udostepnia kod?
Cytat: kva.pl w 10 Listopad 2016, 11:39
A nie odkrywasz czasem kola na nowo? Wydaje mi sie ze sa projekty ktore uzywaly autodocka w BOINCu (find@home mi sie kojarzy), moze udostepnia kod?
WCG używa we wszystkich aplikacjach, niestety zamknęli swój kod...
Jest skrypt przygotowujący wrappera, ale ja wolę to bardziej "elegancko" rozwiązać.
A find@home?
http://findah.ucd.ie/apps.php "Autodock Vina" ;)
Projekt jest zakonczony ale forum aktywne, administrator tez.
Czy są szanse na aplikację dla Ati? Zapytuję, bo pracujesz Krzychu nad cudowną, więc może, w dalszej perspektywie, powstanie liczydło dla konkurencyjnej marki.
Cytat: Ufol w 12 Listopad 2016, 13:37
Czy są szanse na aplikację dla Ati? Zapytuję, bo pracujesz Krzychu nad cudowną, więc może, w dalszej perspektywie, powstanie liczydło dla konkurencyjnej marki.
Na tę chwilę nie ma żadnych szans...
Ok, mam Panowie (i Panie) małą prośbę.
Mam skompilowane aplikacje dla Windows w wersjach OpenCL oraz CUDA, jednak potrzebuję sprawdzić, czy czasami nie linkują do jakiś bibliotek, które są u mnie na dysku, dlatego mam prośbę, abyście spróbowali odpalić je u siebie na grafach.
Linki do aplikacji:
https://www.dropbox.com/s/41xnme2lhmifarq/gmx-windows-cuda.zip
https://www.dropbox.com/s/nfur515k4ofmxm6/gmx-windows-opencl.zip
Aplikacje w załączniku do posta) trzeba rozpakować i kolejno w linii komend wydać polecenia:
gmx grompp -f md.mdp -c npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -o md_0_1.tpr
gmx mdrun -deffnm md_0_1
Jeżeli druga aplikacja będzie działać, to po kilku minutach można ją spokojnie przerwać, szkoda prądu (bo dobre 20 godzin by chodziło).
Niestety nie dołącza kerneli :(
Ale spoko damy rade .
Cytat: krzyszp w 08 Grudzień 2016, 16:40
Jeżeli druga aplikacja będzie działać, to po kilku minutach można ją spokojnie przerwać, szkoda prądu (bo dobre 20 godzin by chodziło).
Prądu szkoda i nie...
Jest zima, a to oznacza że i tak ja osobiście muszę się dogrzewać, więc...
mając wybór między grzejnikiem a GPU <- wybieram GPU :)
Podmieniłem archiwum dla OpenCL...
Będzie apka CUDA lub OpenCl na Linuxa?
Cytat: lakewik w 08 Grudzień 2016, 21:41
Będzie apka CUDA lub OpenCl na Linuxa?
W zasadzie już ją mam, ale nadal walczę z linkowaniem statycznym... Niestety, ta apka "na bogato" używa cmake co mocno sprawę utrudnia...
Mam tak, chyba dziala ? ale GPU Usage chyba widzialem max 10% .....
[smg id=10613 type=preview align=center caption="DD@@Home"]
EDIT:
Po jakichs 10 min srednio 80% (mocno skacze)
Czyli CUDA już działa :)
Z OpenCL nadal walczę...
Tylko mocno pazerne na CPU :o
[smg id=10614 type=full align=center caption="DD@H1"]
Krzysiek zostawic do konca ?
Nie zostawiaj, chodziło mi tylko o to, czy działa na karcie i nie woła jakiś bibliotek.
Ps. Obciążenie CPU można zmienić parametrem -nt X, gdzie "X" to ilość wątków CPU (1, 2, lub np. 6).
Cytat: lakewik w 08 Grudzień 2016, 21:41
Będzie apka CUDA lub OpenCl na Linuxa?
https://www.dropbox.com/s/v13w0x3z503d6j1/gmx-linux-cuda.zipU mnie działa po dodaniu zmiennych środowiskowych do CUDA (nie wiem dlaczego się to automatycznie nie ustawiło):
export PATH=/usr/local/cuda-8.0/bin${PATH:+:${PATH}}
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-8.0/lib64\${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}
$ export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-8.0/lib\${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}
jechać ci ją (testować w sensie)?
Cytat: sknd w 09 Grudzień 2016, 17:19
jechać ci ją (testować w sensie)?
Tak, poproszę. Tylko z 5, góra 10 minut wystarczy (jak pójdzie).
A open CL działa na 4770??
Cytat: Troll81 w 09 Grudzień 2016, 19:59
A open CL działa na 4770??
A Ty mi powiedz... wymagana wersja to 1.1...
Niestety, z kart AMD do dyspozycji mam tylko 7770 i RX 480 (ta ostatnia tylko do końca weekendu).
niemożna uruchomić programu ponieważ na komputerze nie znaleziono vcomp140.dll
po zainstalowaniu - https://www.microsoft.com/en-ca/download/details.aspx?id=48145
problem nadal istnieje
po zainstalowaniu 32bit wersji
program nagle przestał działać, trwa wyszukiwanie rozwiązania....
Open CL mam tak
[smg id=10615 type=preview align=center caption="DD@H2"]
Cytat: mimeq w 10 Grudzień 2016, 01:55
Open CL mam tak
Możesz w pliku startowym zmienić drugą linijkę na:
./gmx mdrun -nt 1 -gpu_id 0 -deffnm md_0_1
Bo wygląda na to, że apka chce wystartować na obu kartach, a kompilowana jest dla kart AMD... (nie ma kerneli dla OpenCL nVidia).
na linuxie mam tak:
[ja@komp gmx-linux-cuda]$ sh start.sh
start.sh: linia 2: ./gmx: Nie ma takiego pliku ani katalogu
start.sh: linia 3: ./gmx: Nie ma takiego pliku ani katalogu
cuda zainstalowane, te PATH co pisałeś powyżej wyexportowane...
co robić?
#!/bin/bash
./gmx grompp -f md.mdp -c npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -o md_0_1.tpr
./gmx mdrun -nt 1 -gpu_id 0 -deffnm md_0_1
Pliki pomagające opisać problem:
C:\Users\Troll\AppData\Local\Temp\WER8D74.tmp.WERInternalMetadata.xml
C:\Users\Troll\AppData\Local\Temp\WERAA09.tmp.appcompat.txt
C:\Users\Troll\AppData\Local\Temp\WERAA39.tmp.mdmp
czmy muszę mieć zainstalowane GROMACS?
Cytat: sknd w 10 Grudzień 2016, 16:27
czmy muszę mieć zainstalowane GROMACS?
no właśnie cała walka odbywa się po to, żeby aplikacja była standalone, bez potrzeby instalacji gromacs'a.
A czy wiesz co u mnie się kopie??
Cytat: Troll81 w 10 Grudzień 2016, 23:01
A czy wiesz co u mnie się kopie??
Nie bardzo... Mam podobny kłopot z OpenCL, ale byłem dotąd przekonany, że to przez dwie różne karty zainstalowane w systemie (GTX1060 + ATI7770)...
Generalnie, działanie wersji OpenCL jest mocno problematyczne (przynajmniej na Windows).
Cytat: krzyszp w 10 Grudzień 2016, 18:09
Cytat: sknd w 10 Grudzień 2016, 16:27
czmy muszę mieć zainstalowane GROMACS?
no właśnie cała walka odbywa się po to, żeby aplikacja była standalone, bez potrzeby instalacji gromacs'a.
no u mnie nadal:
start.sh: linia 2: grompp: nie znaleziono polecenia
start.sh: linia 3: mdrun: nie znaleziono poleceniaa wiem że te dwa polecenia są w składzie gromacs...
Dziwne, bo poleceniem jest gmx, reszta to jego parametry. A samo odpalenie "./gmx" co wywala na konsolę?
no daje "bash: ./gmx: Nie ma takiego pliku ani katalogu"
ale może ja nie mam całości potrzebnych plików,, bo po prostu mam w katalogu to co stąd ściągnięte https://www.dropbox.com/s/v13w0x3z503d6j1/gmx-linux-cuda.zip i nic poza tym, może powinienme zacząć od przeczytania calego tego wątku ;)
EDIT: chyba nie trzeba było nic innego ściągać. no w każdym razie nie hula
EDIT2: doinstalowałem gromacs-5.1-complete, zrobiłem PATH do plik gmx i wyszło tak:
[ja@komp gmx]$ sh start.sh
:-) GROMACS - gmx grompp, VERSION 5.1.4 (-:
GROMACS is written by:
Emile Apol Rossen Apostolov Herman J.C. Berendsen Par Bjelkmar
Aldert van Buuren Rudi van Drunen Anton Feenstra Sebastian Fritsch
Gerrit Groenhof Christoph Junghans Anca Hamuraru Vincent Hindriksen
Dimitrios Karkoulis Peter Kasson Jiri Kraus Carsten Kutzner
Per Larsson Justin A. Lemkul Magnus Lundborg Pieter Meulenhoff
Erik Marklund Teemu Murtola Szilard Pall Sander Pronk
Roland Schulz Alexey Shvetsov Michael Shirts Alfons Sijbers
Peter Tieleman Teemu Virolainen Christian Wennberg Maarten Wolf
and the project leaders:
Mark Abraham, Berk Hess, Erik Lindahl, and David van der Spoel
Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
Copyright (c) 2001-2015, The GROMACS development team at
Uppsala University, Stockholm University and
the Royal Institute of Technology, Sweden.
check out http://www.gromacs.org for more information.
GROMACS is free software; you can redistribute it and/or modify it
under the terms of the GNU Lesser General Public License
as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
of the License, or (at your option) any later version.
GROMACS: gmx grompp, VERSION 5.1.4
Executable: /usr/local/gromacs/gromacs-5.1.4//bin//gmx
Data prefix: /usr/local/gromacs/gromacs-5.1.4/
Command line:
gmx grompp -f md.mdp -c npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -o md_0_1.tpr
Ignoring obsolete mdp entry 'title'
Back Off! I just backed up mdout.mdp to ./#mdout.mdp.1#
Setting the LD random seed to 964890485
Generated 330891 of the 330891 non-bonded parameter combinations
Generating 1-4 interactions: fudge = 0.5
Generated 330891 of the 330891 1-4 parameter combinations
Excluding 3 bonded neighbours molecule type 'Protein'
turning all bonds into constraints...
Excluding 2 bonded neighbours molecule type 'SOL'
turning all bonds into constraints...
Excluding 1 bonded neighbours molecule type 'CL'
turning all bonds into constraints...
Removing all charge groups because cutoff-scheme=Verlet
Analysing residue names:
There are: 209 Protein residues
There are: 12601 Water residues
There are: 4 Ion residues
Analysing Protein...
Analysing residues not classified as Protein/DNA/RNA/Water and splitting into groups...
Number of degrees of freedom in T-Coupling group Protein is 6565.76
Number of degrees of freedom in T-Coupling group non-Protein is 75615.24
Determining Verlet buffer for a tolerance of 0.005 kJ/mol/ps at 300 K
Calculated rlist for 1x1 atom pair-list as 1.035 nm, buffer size 0.035 nm
Set rlist, assuming 4x4 atom pair-list, to 1.000 nm, buffer size 0.000 nm
Note that mdrun will redetermine rlist based on the actual pair-list setup
Reading Coordinates, Velocities and Box size from old trajectory
Will read whole trajectory
Last frame -1 time 100.000
Using frame at t = 100 ps
Starting time for run is 0 ps
Calculating fourier grid dimensions for X Y Z
Using a fourier grid of 48x48x48, spacing 0.154 0.154 0.154
Estimate for the relative computational load of the PME mesh part: 0.20
This run will generate roughly 1145 Mb of data
Back Off! I just backed up md_0_1.tpr to ./#md_0_1.tpr.1#
gcq#570: "This work contains many things which are new and interesting. Unfortunately, everything that is new is not interesting, and everything which is interesting, is not new." (Lev Landau)
:-) GROMACS - gmx mdrun, VERSION 5.1.4 (-:
GROMACS is written by:
Emile Apol Rossen Apostolov Herman J.C. Berendsen Par Bjelkmar
Aldert van Buuren Rudi van Drunen Anton Feenstra Sebastian Fritsch
Gerrit Groenhof Christoph Junghans Anca Hamuraru Vincent Hindriksen
Dimitrios Karkoulis Peter Kasson Jiri Kraus Carsten Kutzner
Per Larsson Justin A. Lemkul Magnus Lundborg Pieter Meulenhoff
Erik Marklund Teemu Murtola Szilard Pall Sander Pronk
Roland Schulz Alexey Shvetsov Michael Shirts Alfons Sijbers
Peter Tieleman Teemu Virolainen Christian Wennberg Maarten Wolf
and the project leaders:
Mark Abraham, Berk Hess, Erik Lindahl, and David van der Spoel
Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
Copyright (c) 2001-2015, The GROMACS development team at
Uppsala University, Stockholm University and
the Royal Institute of Technology, Sweden.
check out http://www.gromacs.org for more information.
GROMACS is free software; you can redistribute it and/or modify it
under the terms of the GNU Lesser General Public License
as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
of the License, or (at your option) any later version.
GROMACS: gmx mdrun, VERSION 5.1.4
Executable: /usr/local/gromacs/gromacs-5.1.4//bin//gmx
Data prefix: /usr/local/gromacs/gromacs-5.1.4/
Command line:
gmx mdrun -nt 1 -gpu_id 0 -deffnm md_0_1
Back Off! I just backed up md_0_1.log to ./#md_0_1.log.1#
Running on 1 node with total 4 cores, 8 logical cores, 1 compatible GPU
Hardware detected:
CPU info:
Vendor: GenuineIntel
Brand: Intel(R) Xeon(R) CPU E3-1230 V2 @ 3.30GHz
SIMD instructions most likely to fit this hardware: AVX_256
SIMD instructions selected at GROMACS compile time: AVX_256
GPU info:
Number of GPUs detected: 1
#0: NVIDIA GeForce GTX 650, compute cap.: 3.0, ECC: no, stat: compatible
Reading file md_0_1.tpr, VERSION 5.1.4 (single precision)
Changing nstlist from 10 to 40, rlist from 1 to 1.097
Using 1 MPI thread
Using 1 OpenMP thread
1 GPU user-selected for this run.
Mapping of GPU ID to the 1 PP rank in this node: 0
Back Off! I just backed up md_0_1.trr to ./#md_0_1.trr.1#
Back Off! I just backed up md_0_1.xtc to ./#md_0_1.xtc.1#
Back Off! I just backed up md_0_1.edr to ./#md_0_1.edr.1#
starting mdrun 'Protein in water'
5000000 steps, 10000.0 ps.
^C
Received the INT signal, stopping at the next NS step
Core t (s) Wall t (s) (%)
Time: 499.293 452.751 110.3
(ns/day) (hour/ns)
Performance: 11.634 2.063
gcq#176: "Have a Nice Day" (R. McDonald)
No wlaśnie tu jest problem...
Chodziło mi o to, czy polecenie:
./gmx zadziała w katalogu ściągniętym ode mnie prawidłowo... Bez instalacji pakietu gromacs (aczkolwiek, jeżeli jest w repozytoriach to w zasadzie czemu nie? Oprócz zadymy z wersjami... 5.1.4 nie jest zgodna z 2016.1)...
no tylko że nie ma prawa zadziałać, bo w tym co ściągałem, nie ma niczego o nazwie gmx...
Cytat: sknd w 11 Grudzień 2016, 21:37
no tylko że nie ma prawa zadziałać, bo w tym co ściągałem, nie ma niczego o nazwie gmx...
Bo faktycznie go nie dodałem w ferworze walki... Już tam jest.
ok, teraz też działa (oczywiście usunąłem gromacs i musiałem chown i chmod +x gmx )
Na serwerze sporo zadań dla vina na Linuksa. Są to wewnętrzne badania, niekomercyjne.
a jak się zapisać do tego projektu? (link z początku wątku nie działa)
EDIT: ok wyguglałem, w razie czego dla kogoś się może przyda: https://boinc.drugdiscoveryathome.com/ (https://boinc.drugdiscoveryathome.com/)
28go startują krótkie zawody BS w projekcie :)
Właśnie podpalamy kotły pod serwerem, żeby miał dość pary na przyjęcie chętnych :)
Cytat28go startują krótkie zawody BS w projekcie
O której?
Już od prawie 16 godzin trwają:
https://boincstats.com/en/stats/challenge/team/chat/863
Jeżeli ktoś jest zainteresowany, aby posłuchać dzisiaj trochę o projekcie:
https://steemit.com/gridcoin/@erkan/meet-the-people-behind-drugdiscovery-home
W powiadomieniach BM czytam: We just have released Smina - a fork of Vina. Smina does same tasks as Vina, just about 10 times faster.. Zastanawia mnie ta różnica w szybkości obróbki WU. Na moich maszynie/nach średni czas dla Vina 0.18 to ok. 5 min a dla Smina już ok. 13 min. A tym samym te ...10 times faster chyba nie działa... :wth: Zdarzają się też dosyć często WU dla Smina, których czas obróbki oscyluje w granicach nawet 1h, choć w takich przypadkach, jak zakładam przyczyną takich czasów jest złożoność danej WU.
A jednak.
Vina wcześniej chodziła na odmiennym zestawie danych wejściowych niż teraz.
Obecnie Smina chodzi na zestawie, który w ogóle nie puszczaliśmy do Viny, bo ta by chodziła dobrze ponad godzinę na nich, a to po prostu nie ma sensu, jeżeli smina zrobi to samo w 10 minut.
I wszystko jasne. Obie aplikacje nadal będę pracowały równolegle czy ze względu na wyższą wydajność algorytmów Sminy Vina idzie na emeryturę?
Cytat: Argento w 09 Luty 2017, 16:33
I wszystko jasne. Obie aplikacje nadal będę pracowały równolegle czy ze względu na wyższą wydajność algorytmów Sminy Vina idzie na emeryturę?
A tego to jeszcze nie wiem, to zależy od ludzi od "science".
Generalnie, z moich testów wynika, że w 99% przypadków Smina jest po prostu gruuuubo szybsza, ale od tej zasady są wyjątki - nie wszystkie funkcje zostały zoptymalizowane, więc może się trafić kombinacja warunków wejściowych, dla których różnica będzie zerowa. Dodatkowo, nadal nie udało mi się skompilować Sminy pod Windows (jeżeli ktoś jest chętny do pomocy w tym temacie, to zapraszam).
a co z zapowiedziana opcja dla kolekcjonerow ? badge :P
Cytat: mimeq w 09 Luty 2017, 23:02
a co z zapowiedziana opcja dla kolekcjonerow ? badge :P
Czekam :)
Ale jest postęp - 3 ikonki już dostałem :)
Czy nieopracowane WU, które są zwracane na serwer z powodu przerwania przez użytkownika czy też przekroczenia deadline (itd.) i oczekujące na ponowne wysyłanie do obrobienia są ujmowane w statusie serwera jako "Tasks ready to send"?
Tak
Tak zakładałem. Jednak zaciekawiła mnie sytuacja, gdzie w statusach serwera było brak WU do wysłania, a ja w w momencie sprawdzania owych statusów dostałem kilka jednostek...
Status serwera jest trzymany 10 minut w cache strony, dlatego takie WU mogą się pojawić i zniknąć niezauważone.
Krótko i merytorycznie. Dziękuję.
Sypnęło WU :p_arr:.
Przeglądałem dziennik zdarzeń BM. Natknąłem się na wers, który mnie zaciekawił Tasks won't finish in time: BOINC runs 99.3% of the time; computation is enabled 100.0% of that.. Skąd taki komunikat? Szukam jakiegoś powiązania za stanem faktycznym obróbki WU. Co ciekawe, ten komunikat pojawia się wyłącznie po wysłaniu wyniku obliczeń na danej WU. Natomiast przy wyłączonym odsyłaniu wyniku widoczny jest jedynie komunikat Computation for task smina-mol2...in_0 is finished.
To dlatego, że jednym z parametrów przydzielanych próbce jest przewidywana ilość obliczeń (we FLOPS'ach), jednak aktualnie liczone WU mają bardzo duży "rozstrzał" czasu wykonywania (np. pomiędzy 4 a 60 minut), przez co manager trochę świruje.
I wszystko jasne :parrrty:.
A kiedy beda zadania na OpenCl? Mam wciaz 7790 i 7870, aktualnie licza folding@home bo nie ma nic medycznego w ramach BOINC co by na nich chodzilo. Koniec POEMa byl dla mnie tragedia :-\
Jak tylko się ogarniemy z tym, co najbardziej wstrzymuje rozwój... Może to potrwa jeszcze parę dni...
W preferencjach projektu można już dodawać adres swojego portfela Ethereum (poprzez 'other account info'), w najbliższych dniach zamierzamy tam testować przelewanie kryptowaluty za przeliczone WU.
Aby przelewy zobaczyć w swoich portfelach trzeba dodać kontrakt "WATCH TOKEN" i podać tam adres:
0xa2319e6e734e47976b80530941a19ba3ea5cda4b
Przypominam, żeby zrobić to już po zaktualizowaniu (ściągnięciu) wszystkich bloków.
Waluta ta nie ma w tej chwili żadnej wartości, służy nam do testowania rozwiązań.
mogę pomóc w testowaniu ale potrzebuję poradnika dla idioty krok po kroku jak założyć konto do kryptowaluty i jak to skonfigurować :)
Z pewnością bardzo się coś takiego przyda.
Cytat: toms83 w 15 Luty 2017, 17:33
Z pewnością bardzo się coś takiego przyda.
Ok, wrzucę później dokładniejszy opis jak to zrobić na głównej.
Proszę bardzo:
http://www.boincatpoland.org/ethereum-drugdiscovery-poradnik/
Czym różni się Ethereum od Mist?
Jak mniemam nie ma możliwość zmiany lokalizacji blockchain'a z partycji systemowej na inną?
Cytat: Argento w 16 Luty 2017, 09:32
Czym różni się Ethereum od Mist?
Jak mniemam nie ma możliwość zmiany lokalizacji blockchain'a z partycji systemowej na inną?
Mist jest ciut bardziej rozbudowany.
Jest możliwość zmiany lokalizacji blockchaina, sam to zrobiłem kilka miesięcy temu, ale zabij mnie - nie pamiętam w jaki sposób ;)
Projekt ma już odznaki, progi są takie:
10k
100k
1000k
50'000k
250'000k
1'000'000k
10'000'000k
100'000'000k
A gdzie znajdę grafiki?
Przy okazji - bardzo wysokie progi - jak rozumiem to zasługa aplikacji GPU?
Jeśli tak, to kiedy się pojawi i czego można się spodziewać?
I jeszcze jedno. Nie za dużo odznak jeśli wprowadzisz je dla każdej aplikacji?
Kolejno:
1. Tak, z powodu GPU głównie.
2. Być może jeszcze dzisiaj w kanale testowym pojawi się krótka seria dla Linux CUDA aplikacji Gromacs - zależnie od wyniku tego testy zobaczymy, co dalej. W przypadku OpenCL nadal nie mogę przeskoczyć sprawy kompilacji kerneli... (o tym zaraz)
3. Odznaki dla aplikacji będą "gwiazdkowe". Tak wiem, może się ich "trochę" naprodukować, ale ludzie po prostu się o nie dopisują (zwłaszcza, że niektóre aplikacje są i będą tylko CPU).
Ps. Jeżeli jest na sali spec, który potrafi skompilować Gromacsa OpenCL (najlepiej i windows i linuks) jako apkę "portable" (sam exec 'gmx'), to BARDZO proszę o pomoc :)
Cytat: krzyszp w 15 Luty 2017, 20:17
Proszę bardzo:
http://www.boincatpoland.org/ethereum-drugdiscovery-poradnik/
Jak
krzyszp poinformował w poradniku
blockchain może ważyć ok. 60GB. Sporo, ale pocieszające jest, że można przerywać download. Soft posiada checkpoint'y, a więc dociąga od momentu przerwania. Już mniej radosny jest jego apetyt na RAM przy ściąganiu danych, gdyż oscyluje w okolicach 3GB.
Niestety ten klient Ethereum jest jakiś niedorobiony - ściąga ~90k-100k bloków i stop aż do ponownego uruchomienia.
Cytat: Szopler w 16 Luty 2017, 18:31
Niestety ten klient Ethereum jest jakiś niedorobiony - ściąga ~90k-100k bloków i stop aż do ponownego uruchomienia.
Mist, czy Wallet?
A poza tym, tak, przerywa, ale po kilku minutach kontynuuje. Po prostu działa z niskim priorytetem.
Wallet...
To spróbuj Mista, IMHO jest ciut lepszy (ale się nie wykłócam o to) :)
krzyszp, a taka sytuacja. Na chwilę obecną Ethereum ciągnie blockchain i faktycznie trochę z "oporem". Po prawie 6h zrzucił prawie 1,360,000 z 3,195,519 bloków. I teraz zatrzymuję Ethereum i odpalam Mist. Czy będzie dociągał blockchain od momentu przerwania Ethereum czy zacznie od zera? Pytam, ponieważ przy odpalaniu Ethereum nie zauważyłem standardowego procesu instalacji a bardziej wyglądało mi to na portable.
Tak, u mnie kontynuował.
Edit:
Ja ich używam zamiennie na tych samych danych zarówno blockchaina jak i portfela
A czy można liczyć na konto drużyny?? :D w sensie by B@P zarabiało?
Cytat: Troll81 w 16 Luty 2017, 20:58
A czy można liczyć na konto drużyny?? :D w sensie by B@P zarabiało?
Jasne!
Trzeba tylko portfel drużynowy założyć i podawać jego adres w swoich ustawieniach :)
Przypomnę tylko, że obecnie testowana waluta ma zerową wartość, dopiero jak wszystko będzie dograne na tip-top to ustawię "realną" walutę.
Po prostu nikt jeszcze czegoś takiego nie robił, więc musimy masę eksperymentów porobić zanim dojdzie do prawdziwej kasy...
Dodatkowo, prowadzimy teraz rozmowy z jednym ze sławniejszych uniwersytetów, żeby zrobić dość "konkretną" pracę dla nich charytatywnie. Jak coś się urodzi, to oczywiście będę informował.
Po 24 godzinach Mist (po zmianie z Ethereum) ściagnął ~3,200,00 bloków o wadze nie całych 13GB. Dlaczego tak daleko do ~60GB...???
I czy każdorazowe odpalenie Mista alokuje tak dużo RAMu, tj. 2,5-3GB?
Po wybraniu swojego portfela widzę taki oto komunikat Accounts can't display incoming transactions, but hold and send ether. To see incoming transactions create a wallet contract to store ether.. O co chodzi :book:??
Nie wiem, dlaczego u Ciebie to jest 13GB, u mnie zajmuje całość ~60GB. Zużycie RAM waha się pomiędzy 1.5 a 2.5GB, niemniej przecież portfel nie musi być cały czas odpalony, wystarczy raz na jakiś czas zsynchronizować go z siecią.
Waha ;)
Poprawiłem :)
Cytat: krzyszp w 17 Luty 2017, 13:26
Nie wiem, dlaczego u Ciebie to jest 13GB, u mnie zajmuje całość ~60GB.
Jedyny folder, który ze względu na wagę i samą nazwę, czyli %\AppData\Roaming\Ethereum\geth\chaindata\, wskazuje na łańcuch bloków waży właśnie ~12,6GB.
krzyszp, wyżej pisałem o komunikacie w zakładce portfela. Możesz coś na temat jego treści mi wskazać?
U mnie dopiero po synchronizacji czasu systemowego ruszyło ściąganie bloków, a wczoraj portfel cały dzień był odpalony i nic nie pobrał %)
Cytat: Argento w 17 Luty 2017, 12:45
Po wybraniu swojego portfela widzę taki oto komunikat Accounts can't display incoming transactions, but hold and send ether. To see incoming transactions create a wallet contract to store ether.. O co chodzi :book:??
To oznacza, żebyś linkiem z tego komunikatu utworzył portfel, bo na starcie masz jakby konto tylko do przechowywania waluty, ale bez wyświetlania poszczególnych transakcji.
Z tego co wyczytałem, to pozycję blockchaina to trzeba wywołać aplikację do instalacji z odpowiednią komendą i wskazaniem miejsca zapisywania. Niestety jestem zbyt mało w tym ogarnięty aby dojść do tego z jaką komendą trzeba instalować tę aplikację na Windowsie...
EDIT: jest opcja w Mist żeby wybrać przy instalacji folder na blocki - zobaczymy czy to będzie tam gdzie wybrałem :)
Cytat: Cyfron w 17 Luty 2017, 17:21
jest opcja w Mist żeby wybrać przy instalacji folder na blocki - zobaczymy czy to będzie tam gdzie wybrałem :)
Wskażesz drogę :p_arr:?
Może dołożyć taki punkt w tym tutorialu drugDiscovery?
Co do tutoriala - pobieracie Mist na windowsa ze strony wskazanej w poradniku
Podczas instalacji najpierw wskazujecie ścieżkę do instalacji programu a w kolejnym oknie wskazujecie ścieżkę, do katalogu dla blocków :)
Chyba to działa :)
Cytat: Cyfron w 17 Luty 2017, 19:00
Podczas instalacji najpierw wskazujecie ścieżkę do instalacji programu a w kolejnym oknie wskazujecie ścieżkę, do katalogu dla blocków :)
Dopiero teraz zauważyłem, że jest instalator Mist :facepalm2:. Ja zrzuciłem archiwum zip, a to nie jest instalator a portable.
Cytat: PDH w 17 Luty 2017, 14:56
U mnie dopiero po synchronizacji czasu systemowego ruszyło ściąganie bloków, a wczoraj portfel cały dzień był odpalony i nic nie pobrał %)
To rozwiązało także mój problem z synchronizacją bloków - dzięki!
Punktacja, mimo, że dla mnie bez większego znaczenia jest okrutnie motywująca - u mnie przedział 0.30 do 4.00 punktów za WU. Taki swoisty oksymoron :parrrty:.
co jaki czas i na jakiej zasadzie dodawana jest kryptowaluta? Czy Mist musi być uruchomiony aby otrzymywać walutę, czy wystarczy go odpalić np raz na miesiąc/kwartał/rok?
Cytat: Cyfron w 18 Luty 2017, 12:03
co jaki czas i na jakiej zasadzie dodawana jest kryptowaluta? Czy Mist musi być uruchomiony aby otrzymywać walutę, czy wystarczy go odpalić np raz na miesiąc/kwartał/rok?
Również jestem nie doświadczony w tym temacie, ale zakładam, że ethery trafią na konkretne konto w przypadku, gdy wynik obróbki WU będzie istotny w meritum badań... Natomiast sam portfel nie musi działać cały czas, a odpalany czasowo w celu synchronizacji bloków no i sprawdzenia zawartości samego portfela.
Cytat: Cyfron w 18 Luty 2017, 12:03
co jaki czas i na jakiej zasadzie dodawana jest kryptowaluta? Czy Mist musi być uruchomiony aby otrzymywać walutę, czy wystarczy go odpalić np raz na miesiąc/kwartał/rok?
Kwestia trybu przelewania waluty jest tematem, który poddaliśmy na forum projektu pod dyskusję.
Portfel nie musi być uruchomiony, transakcja trafia do blockchaina i tam jest do odczytania już zawsze.
czyli w ogóle nie trzeba nic instalować oprócz liczenia DD@H?
Cytat: Troll81 w 18 Luty 2017, 16:09
czyli w ogóle nie trzeba nic instalować oprócz liczenia DD@H?
W teorii nie, mozna na jakims popularnym serwisie sobie nawet portfel utworzyc i wtedy wystarczy klucze przechowywac, jednak wygodniej miec u siebie Mist'a lub Ethereum Wallet i raz na jakis czas synchronizowac blockchain'a.
no ale jak kogoś w ogóle krypto nie interesuje to nie musi chyba nic robić.
Przy okazji - co wtedy dzieje się z funduszami, które były przewidziane do wypłaty za takie próbki? Bo może być więcej takich ludzi, którzy nie chcą lub nie wiedzą o zarabianiu w kryptowalutach. Czy macie na to jakiś pomysł?
Zgadza sie, jak kogos nie interesuje krypto to w ogole nic nie musi robic (lub np. tylko podac portfel jakiejs innej osoby/grupy/organizacji).
Co do takich zaleweglys srodkow, to jeszcze nie ma decyzji, ale najprawdopodobniej po jakims czasie na zmiane decyzji (np. rok) moga byc np. skierowane do osob, ktore dana partie WU liczyly.
o przykladowe rozwiazanie, licze na dyskusje w tym wzgledzie,
Zaproponowane podejście o przechodzeniu takich nieprzydzielonych środków pozostałym liczydłowym danej partii jest według mnie sprawiedliwe. Można ewentualnie rozważyć jeszcze jakieś "darowizny" na rzecz innych projektów czy organizacji - to może marketingowo pomóc projektowi :)
CytatW teorii nie, mozna na jakims popularnym serwisie sobie nawet portfel utworzyc i wtedy wystarczy klucze przechowywac, jednak wygodniej miec u siebie Mist'a lub Ethereum Wallet i raz na jakis czas synchronizowac blockchain'a.
nie mam wolnych 60gb
CytatZgadza sie, jak kogos nie interesuje krypto to w ogole nic nie musi robic (lub np. tylko podac portfel jakiejs innej osoby/grupy/organizacji).
ja chcę liczyć na konto B@P :D gdzie podać taki portfel?
Ktoś musi go założyć u siebie i podać adres tutaj :)
A GB ja mam dość, ale boję się, że przy jakiś pracach pomylę portfele i będzie dym :)
A ja szukam informacji dlaczego blockchain u mnie waży "tylko" ~13GB :book:. W kilku miejscach znalazłem starsze informacje o jego szacunkowej wadze właśnie w ~60GB, ale o tym, że stracił wagę już nie... Kilkakrotnie odpalałem Mista i Ethereum, aby dokonał synchronizacji i tak czynił. Jednak nadal folder chaindata waży ~13GB przy 6285 plikach *.ldb, które jak mniemam są blokami.
Cytat: Troll81 w 18 Luty 2017, 17:51
CytatW teorii nie, mozna na jakims popularnym serwisie sobie nawet portfel utworzyc i wtedy wystarczy klucze przechowywac, jednak wygodniej miec u siebie Mist'a lub Ethereum Wallet i raz na jakis czas synchronizowac blockchain'a.
nie mam wolnych 60gb
CytatZgadza sie, jak kogos nie interesuje krypto to w ogole nic nie musi robic (lub np. tylko podac portfel jakiejs innej osoby/grupy/organizacji).
ja chcę liczyć na konto B@P :D gdzie podać taki portfel?
Mogę założyć portfel fundacyjny i kto nie chce "marnować" 60GB to będzie mógł tam wrzucać.
Cytat: Argento w 18 Luty 2017, 19:48
A ja szukam informacji dlaczego blockchain u mnie waży "tylko" ~13GB :book:. W kilku miejscach znalazłem starsze informacje o jego szacunkowej wadze właśnie w ~60GB, ale o tym, że stracił wagę już nie... Kilkakrotnie odpalałem Mista i Ethereum, aby dokonał synchronizacji i tak czynił. Jednak nadal folder chaindata waży ~13GB przy 6285 plikach *.ldb, które jak mniemam są blokami.
Wszystko się zgadza, ja mam podobnie. Klient geth działa w trybie synchronizacji bloków fast...
Cytat: PDH w 18 Luty 2017, 21:52
Klient geth działa w trybie synchronizacji bloków fast...
Mimo, że nie mam pojęcia co to znaczy, to zakładam, że wszystko zrobiłem jak należy i działa to jak należy :p_arr:.
Tobas
CytatMogę założyć portfel fundacyjny...
Uczyń to dobry człowieku i daj nam namiary nań :p_arr:
Cytat: necavi w 19 Luty 2017, 18:02
Tobas CytatMogę założyć portfel fundacyjny...
Uczyń to dobry człowieku i daj nam namiary nań :p_arr:
Otóż to. :whip:
W ostatnich dniach dostałem sześć WU TEST dd_short_gmx i wszystkie wyłożyły się w ciągu ~4 sekund. Plik stderr przyjął komunikat process exited with code 195 (0xc3, -61). Czegoś brakuje aplikacji? Widziałem podobny błąd również w innych projektach.
Czy test przelewania waluty miał już miejsce i czy jakieś konkretne warunki trzeba spełnić żeby wziąć w nim udział?
Cytat: toms83 w 04 Marzec 2017, 13:49
Czy test przelewania waluty miał już miejsce i czy jakieś konkretne warunki trzeba spełnić żeby wziąć w nim udział?
Nie, jeszcze nie zrobiliśmy testów (aczkolwiek pracujemy nad tym), sprawa jest troszkę bardziej skomplikowana, bo całość będzie przeprowadzana za pomocą tzw. smart-contracts. Nikt nigdy jeszcze tego nie zrobił, więc nie można "podeprzeć się" jakimiś wcześniejszymi pracami.
Co do warunków, to jedynym jest podanie swojego adresu portfela Ethereum w preferencjach na stronie projektu.
Dzięki za info - myślałem, że coś skopałem, że w portfelu nic się nie pojawia :)
Daj znać jak będą pierwsze transakcje :)
I ja z czystej ciekawości synchronizuję blockchain średnio raz w tygodniu. I zauważyłem, że, cytuję z poradnika "... późniejsze uruchomienia będą już importować tylko nowe części i zwykle zajmuje to najwyżej kilka minut." nie ma nic wspólnego ze stanem faktycznym. Przy przyzwoitym łączu synchronizacja/import nowych części raz w tygodniu (~10-25 peer; ~15,000 blocks left) trwa ~3h. I tak za każdym razem.
Druga sprawa. Każda synchronizacja powoduje fragmentację folderu chaindata o ~15%, gdzie wartość ta jest dużą zasługą pliku *.log, którego waga przekracza 130MB.
W każdym razie takie okrutne rzeczy dzieją się u mnie :parrrty:.
Ja po stracie 4-5 portfeli w MIST postawiłem sobie do synchronizacji maszynę wirtualną (4 rdzenie + 12giga ram)która działa sobie w tle, ale fakt faktem działanie tego MISTa jest coraz gorsze i wolniejsze.
U mnie ostatnio pełna synchronizacja trwała 1,5 tygodnia na MainNet i 4-5 dni dni na TestNet w obu przypadkach miałem 10-15 peerów <- istna masakra.
Na stronie konta w DD pojawiła się pozycja Tokens to withdraw (prototype!) z jakimś stringiem numerycznym. Zakładam, że ma to coś wspólnego z Ethereum. Czym są owe tokeny i dlaczego są do wycofania?
Cytat: Argento w 25 Marzec 2017, 20:04
Na stronie konta w DD pojawiła się pozycja Tokens to withdraw (prototype!) z jakimś stringiem numerycznym. Zakładam, że ma to coś wspólnego z Ethereum. Czym są owe tokeny i dlaczego są do wycofania?
To ma być taka DEMOwa informacja o niby tokenach do wypłacenia <- dojdzie jeszcze informacja ile to ETH i ile to USD.
Na razie jest to czysto informacyjne bo za aktualne WU nie są naliczane tokeny.
Zna ktoś sposób na reset hasła do Ethereum? Nie zdarza mnie się mieć problem z hasłami, a Ethereum się buntuje... :attack:
Cytat: Argento w 30 Marzec 2017, 11:18
Zna ktoś sposób na reset hasła do Ethereum? Nie zdarza mnie się mieć problem z hasłami, a Ethereum się buntuje... :attack:
z tego co wiem nie takiego sposobu.
Ja tak straciłem w sumie 4-5 portfeli.
Musiałem zakładać na nowo <- w tej chwili MIST/Ethereum mam na maszynie wirtualnej z nadzieją że będzie dobrze
Cytat: goofyx w 30 Marzec 2017, 11:20
Cytat: Argento w 30 Marzec 2017, 11:18
Zna ktoś sposób na reset hasła do Ethereum? Nie zdarza mnie się mieć problem z hasłami, a Ethereum się buntuje... :attack:
z tego co wiem nie takiego sposobu.
Ja tak straciłem w sumie 4-5 portfeli.
Musiałem zakładać na nowo <- w tej chwili MIST/Ethereum mam na maszynie wirtualnej z nadzieją że będzie dobrze
Idealne do przekoniania ludzi do kryptowalut :D
Cytat: Martin Fox w 30 Marzec 2017, 14:21
Cytat: goofyx w 30 Marzec 2017, 11:20
Cytat: Argento w 30 Marzec 2017, 11:18
Zna ktoś sposób na reset hasła do Ethereum? Nie zdarza mnie się mieć problem z hasłami, a Ethereum się buntuje... :attack:
z tego co wiem nie takiego sposobu.
Ja tak straciłem w sumie 4-5 portfeli.
Musiałem zakładać na nowo <- w tej chwili MIST/Ethereum mam na maszynie wirtualnej z nadzieją że będzie dobrze
Idealne do przekoniania ludzi do kryptowalut :D
hmm, nie tak do końca.
Tak jak pisałem problem mam z portfelami z MIST. Nie mam problemu z portfelem etereum założonym przez www na ethwalet czy jakoś tak.
Ale fakt, faktem MIST pod windowsa jest ciutkę za delikatny, pod linuchem podobno jest ok
O co chodzi z komunikatem w BM...?
Cytat: Argento w 04 Kwiecień 2017, 12:44
O co chodzi z komunikatem w BM...?
W skrócie chodzi o to, że rosyjska część zespołu po prostu wywaliła nas z całego przedsięwzięcia. W związku z tym niestety byliśmy zmuszeni do zamknięcia serwera.
Cytat: goofyx w 04 Kwiecień 2017, 13:02
Cytat: Argento w 04 Kwiecień 2017, 12:44
O co chodzi z komunikatem w BM...?
W skrócie chodzi o to, że rosyjska część zespołu po prostu wywaliła nas z całego przedsięwzięcia. W związku z tym niestety byliśmy zmuszeni do zamknięcia serwera.
W skrócie chodzi o to, że wielu z nas, jeżeli nie większość, uczestniczy/ła w tym projekcie i takie "w skrócie..." jest po prostu nie fair. Żadnych informacji czy uwalać resztę pobranych WU; co z tymi, które nie zostały zaraportowane...
Cytat: Argento w 04 Kwiecień 2017, 13:10
Cytat: goofyx w 04 Kwiecień 2017, 13:02
Cytat: Argento w 04 Kwiecień 2017, 12:44
O co chodzi z komunikatem w BM...?
W skrócie chodzi o to, że rosyjska część zespołu po prostu wywaliła nas z całego przedsięwzięcia. W związku z tym niestety byliśmy zmuszeni do zamknięcia serwera.
W skrócie chodzi o to, że wielu z nas, jeżeli nie większość, uczestniczy/ła w tym projekcie i takie "w skrócie..." jest po prostu nie fair. Żadnych informacji czy uwalać resztę pobranych WU; co z tymi, które nie zostały zaraportowane...
Nie wiem co mam powiedzieć.
Gdy startowaliśmy projekt 6 miesięcy temu był plan, aby DD@H był fundamentem dla SONM, chodziło o przygotowanie funkcji/mechanizmów/technologii umożliwiających handel mocą obliczeniową w oparciu o serwery boincowe. Jak dobrze wiecie jakoś w grudniu projekt DD@H był już w fazie testowej i dawał testowo WU. Od stycznia z małymi przerwami (oczekiwania na materiały od zespołu naukowego) cały czas dawaliśmy materiał do liczenia. Niestety w lutym w momencie przygotować do pre-ICO (mini zbiórka przed główną zbiórką) wszystko zaczęło się sypać ze względu na fakt, iż Sergey Ponomarev rozpoczął wywieranie wpływu na Andrey Voronkov celem przejęcia projektu <- dochodziło nawet do szantaży itp Niestety po 1,5 miesiącach negocjacji i rozmów oraz po kolejnych ustaleniach, które odbyły się dosłownie 3 dni (po których wszyscy potwierdzili, że wracamy do pierwotnych umówi sprzed 5-6 miesięcy) temu poprzedniej nocy zostaliśmy całkowicie usunięci z zespołu <- o czym dowiedzieliśmy się kompletnie przez przypadek rano ok.8:30 odwiedzając stronę sonm.io. W związku z takim potraktowaniem naszego zespołu nie mogliśmy zareagować inaczej jak zamknąć serwer DD@H.
Jako, że wszelkie nasze skrypty jakie przygotowaliśmy dla DD@H przez ostatnie 6 miesięcy zostało usunięte z serwera uważam, że nie ma możliwości aby przywrócić jego działanie w aktualnym stanie.
Ze swojej strony mogę powiedzieć, że bardzo mi przykro z powodu takiej sytuacji... jednak nie mogliśmy uczestniczyć
Niestety aktualny właściciel DD@H w osobie Pana Andrey Voronkov nie specjalnie jest zainteresowany rozwojem projektu w kierunku sprzedaży mocy obliczeniowej za krypto-walutę jak to było przewidziane od samego początku.
Zespół SONM ma podobno całkowicie zrezygnować używania platformy BOINC.
No to spektakularny fail... :(
Wyczuwam politbagno... :dunno:
Od siebie dodam, że to co się wydarzyło nawet brzmi... Dziwnie.
Otóż obecnie realną władzę w projekcie (SONM) ma osoba, z którą nie została podpisana żadna umowa. Natomiast cała akcja odbyła się wbrew spisanemu i podpisanemu przez nas kontraktowi.
W obecnej chwili muszę przyznać, że zostaliśmy po prostu oszukani, a co więcej, obawiam się, że całe przedsięwzięcie, którego częścią był DD@H przeradza się w zwykłą zbiórkę obliczoną na oszukanie inwestorów.
W związku z tym, bardzo realnie się zastanawiam nad podjęciem kroków prawnych, jednak nie wiem, czy jest jakikolwiek tego sens, skoro wszystko teraz dzieje się w Rosji...
Cytat: Szopler w 04 Kwiecień 2017, 13:37
Wyczuwam politbagno... :dunno:
..., bo faktycznie po ostatnich wypowiedziach polskich prokuratorów w sprawie "wiecie czego" związanego "wiecie z czym" jakoś to powiązane się wydaje. Niechaj Pan Andrey Voronkov wytaułuje sobie, że cel projektu winien być ponad jakimikolwiek podziałami/wypowiedziami/skojarzeniami.
Czy to znaczy goofyx że masz wolne moce przerobowe? 8)
Cytat: Cyfron w 04 Kwiecień 2017, 15:30
Czy to znaczy goofyx że masz wolne moce przerobowe? 8)
Optymista-egoista :D
Cytat: Cyfron w 04 Kwiecień 2017, 15:30
Czy to znaczy goofyx że masz wolne moce przerobowe? 8)
tia...
zwolniło się ich trochę.
Nagłośnić sprawę w światku BOINC na różnych forach i ogłosić ignorowanie ruskich projektów. (osobiście odłączam się od Amicable numbers i olewam newsy odnośnie każdego ruskiego projektu).
No wielka szkoda. Zapowiadało się, że będzie to coś bardzo innowacyjnego w Boinc. No nic, trzymamy kciuki za inne projekty/pomysły. :ahoy:
Strasznylipton z tego wyszedł. Ale pamietam krzysku jak o tym rozmawialiśmy i mówiłem ze to zbyt piekne by poszło gładko... :(
@Troll81Cytatmówiłem ze to zbyt piękne by poszło gładko...
Toś wykrakał :deadman:
@tito Cytat... i ogłosić ignorowanie ruskich projektów.
No nie wiem czy to dobry pomysł. Najwięcej dostanie się tym, którzy najmniej zawinili - inne projekty. Co do bojkotu projektu "przejętego" to się nie dziwię.
@tito Cytat... i ogłosić ignorowanie ruskich projektów.
No nie wiem czy to dobry pomysł. Najwięcej dostanie się tym, którzy najmniej zawinili - inne projekty. Co do bojkotu projektu "przejętego" to się nie dziwię.
[/quote]
zgadzam się, co to za odpowiedzialność zbiorowa? Nie bądźmy jak dzieci/politycy
Może trochę mnie poniosło, ale wiecie - nerwy.
@sknd - ale aby tak od razu mnie od polityków wyzywać? XD
Nie uczestniczyłem w DD, ale jestem politykiem. I patrząc co się dzieje w Rosji to doradzam 10 razy przemyśleć sprawę nim wejdzie się w głębsze kontakty z nimi.
Niestety oni mają fazę supernacjonalizmu (jak Niemcy od 1936-45) i wystarczy by ktoś z nich pomyślał że "polscy najemnicy zabijają dzieci w Donbasie" i im odbija.
Wielka szkoda, że pomysł sprzedaży mocy BOINC nie wypalił. Ludzie są chciwi i liczyliby nawet gdyby im się koszty nie zwracały.
Cytat: IThorne w 05 Kwiecień 2017, 12:04
Wielka szkoda, że pomysł sprzedaży mocy BOINC nie wypalił. Ludzie są chciwi i liczyliby nawet gdyby im się koszty nie zwracały.
Może to i lepiej, że nie wypaliło. Nie chciałbym, żeby forum zostało zalane ludźmi o takiej mentalności.
Cytat: Ósemka w 08 Kwiecień 2017, 05:29
Cytat: IThorne w 05 Kwiecień 2017, 12:04
Wielka szkoda, że pomysł sprzedaży mocy BOINC nie wypalił. Ludzie są chciwi i liczyliby nawet gdyby im się koszty nie zwracały.
Może to i lepiej, że nie wypaliło. Nie chciałbym, żeby forum zostało zalane ludźmi o takiej mentalności.
ósemka, nie zgodzę się z Tobą. Nie sądzę, aby "fala i jej mentalność", o której napisałeś w jakikolwiek sposób wpłynęła na forum. A tym samym status quo celu projektu nie zostało by zachwiane.
Cytat: Argento w 08 Kwiecień 2017, 09:28
Nie sądzę, aby "fala i jej mentalność", o której napisałeś w jakikolwiek sposób wpłynęła na forum.
A ja się obawiam, że większość rozmów wyglądałaby podobnie do tej:
http://www.boincatpoland.org/smf/gielda/kupie-cos-do-liczenia-bitcoin-maks-do-600zl/msg247212/#msg247212Być może moje obawy są niesłuszne, bo nie można wszystkich do jednego wora ładować, ale intuicja podpowiada mi, że nie byłoby za dobrze.
Zawsze pojawią się chciwi ludzie co za grosz sprzedadzą własną matkę.
Na szczęście najważniejsze projekty działają jako nonprofit, więc każdy znajdzie coś dla siebie.
Cytat: Ósemka w 19 Kwiecień 2017, 22:00
A ja się obawiam, że większość rozmów wyglądałaby podobnie do tej:
http://www.boincatpoland.org/smf/gielda/kupie-cos-do-liczenia-bitcoin-maks-do-600zl/msg247212/#msg247212
Być może moje obawy są niesłuszne, bo nie można wszystkich do jednego wora ładować, ale intuicja podpowiada mi, że nie byłoby za dobrze.
Tym linkiem przypomniałeś mi ile nerwów mnie to kosztowało i jaki miałem kiedyś zapał by pomagać innym... Jednego razu siedziałem i kombinowałem przez prawie godzinę byle tylko mu pomóc :wacko:
Widzę że projekt wrócił. Mam nadzieję że tym razem obędzie się bez takich problemów jak ostatnio :ahoy:
https://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2093
:respect: dla Krzycha za zaangażowanie :respect: :respect: :respect:
Dlaczego projekt trzeba dopinać ręcznie? Niestety wciąż nie widać go na liście w boincowym menedżerze.
Cytat: Ufol w 18 Lipiec 2017, 16:25
Dlaczego projekt trzeba dopinać ręcznie? Niestety wciąż nie widać go na liście w boincowym menedżerze.
Może trzeba zapytać twórców BM.
Sympatycznie sypie WU :respect:.
W najbliższym czasie planujecie aplikacje pod Androida? Moje sprzęty mogłyby potestować...
Niestety nie ma takich planów na razie.
Wszystko w ramach zespolu dogadane? Juz lubimy ten projekt znowu? ;)
Cytat: kva.pl w 02 Sierpień 2017, 19:01
Wszystko w ramach zespolu dogadane? Juz lubimy ten projekt znowu? ;)
Z pewną ostrożnością, ale działamy...
Większy nacisk teraz jest na wiedzę, mniejszy na komercję...
Cytat: krzyszp w 02 Sierpień 2017, 23:32
Cytat: kva.pl w 02 Sierpień 2017, 19:01
Wszystko w ramach zespolu dogadane? Juz lubimy ten projekt znowu? ;)
Z pewną ostrożnością, ale działamy...
Większy nacisk teraz jest na wiedzę, mniejszy na komercję...
I tak powinno być od początku. :respect:
krzyszp
Nowa apka dla CUDA + CPU z AVX2 ?
Dlaczego? I czy tak ma być w przyszłości?
Bo o ile NVidię odpowiednią posiadam o tyle CPU już nie...
AVX256 (czyli AVX1).
Ustawienie kompilacji dla tylko SSE4.1 powoduje, że np. moja karta jest karmiona jednym wątkiem tylko na 30%, przy AVX jest to już 40-50%...
Generalnie, jaki Ty masz CPU?
XEON 1235V2
Jeśli AVX256 to AVX1
to AVX2 to??
A AVX512 to będzie co?
Generalnie, to ja mogę dla każdej prawie opcji ustawić kompilację (poza AVX512, bo mój CPU go nie ma), ale to po ustabilizowaniu wrappera, bo sporo plan_class'ów będę musiał napisać...
Edit:
Kolejne rozszerzenia list rozkazów CPU dla których można skompilować Gromacsa to:
SSE2
SSE4.1
AVX_FME128 (Ryzen?)
AVX_256
AVX2_256
AVX512
AVX512_KLN
OK.
Ale jeśli jest słabe obciążenie, dla 1 WU to prostym rozwiązaniem wydaje się możliwość puszczenia 2, lub 3 WU jednocześnie.
Tak, spokojnie można puścić 2WU na jednej karcie.
Niestety, Gromacs tak ma i nie mam na to wpływu :(
Czy można podmienić gmx który jest wysyłany przez serwer na ten z pakietu gromacs zainstalowanego lokalnie? U mnie na Centos 7 się wywala bo libstdc++ jest w starszej wersji i nie eksportuje niektórych funkcji wymaganych przez "oficjalną" wersję gmx. Na forum projektu wrzuciłem linka do WU który mi się wywalił przez to.
Jak najbardziej można, o ile to będzie Gromacs w wersji 5.1.4 lub wyższej.
As apps are now under tests, only users with test applications enabled will get tasks.
Nie widzę takiej opcji?
Bo faula strzeliłem i nie zaznaczyłem apce, że jest testowa :(
Jak masz zaznaczoną aplikację Gromacs i Use NVIDIA GPU to powinna pójść (o ile Twoje ograniczenia czasowe na to pozwolą).
Dobra - mam 1 WU.
Wykarmienie 1080Ti za pomocą mojego biednego XEONa jest niemożliwe.
Przy 7miu wątkach obciążenie oscyluje 29-39% zaś GPU boostuje bardzo biednie do ~ 1650MHz, w innych projektach 1900MHz
Przy 2 WU i 7 wątkach 39-60% oraz znacznie większe skoki.
8 wątkow 49-61% Boost 1900MHz
3WU + 8wątków -> 60-70%
Wygladalo ze bedzie szybko na 1060, wychodzilem z domu bylo 4x% po 4x min aktualnie 99,675% 3h44min ;)
AVG Load wedlug GPU-Z sensor 46%
Na jakiej magicznej zasadzie są naliczane pkt?
Widziałem 1060, która przeliczyła WU w 18000 sekund i dostała 180000pkt, oraz 1080ti która przy tym samym czasie dostała ~ 480000pkt.
W dodatku ta sama 1080ti dostała za podobną próbkę 48000pkt
Cytat: krzyszp w 17 Październik 2017, 16:38
Jak najbardziej można, o ile to będzie Gromacs w wersji 5.1.4 lub wyższej.
Mam zainstalowaną wersję 2016.4-1.el7. To jest nowsza czy starsza? Tutaj jest link do strony z opisem tej paczki:
https://centos.pkgs.org/7/epel-x86_64/gromacs-2016.4-1.el7.x86_64.rpm.html
To jest najnowsza wersja, powinno działać.
Naprawiłem też błąd, który przy więcej niż jedna karcie odpalał zadania tylko na pierwszej, w najnowszych wersjach apki powinna każda karta dostać swoje zadanie (potwierdzenie potrzebne).
Generalnie, czasy wykonywania aplikacji to średnio 7h, zależnie od CPU i GPU.
Jutro będę już się starać wypuścić zadania "produkcyjne", bo obecnie każdy ma te samo WU.
Punktacja wariuje, bo jest obliczana przez serwer, który musi się "nauczyć" od hostów czasów (musi średnie sobie powyliczać). Problemem jest to, że Gromacs mocno wykorzystuje losowość i te same WU odpalone dwa razy na tym samym hoście może mieć nawet 50% rozstrzał czasu wykonywania.
Cytat: krzyszp w 17 Październik 2017, 21:44
To jest najnowsza wersja, powinno działać.
Chyba jednak sobie nie policzę:
CytatFatal error:
GPU ID string set, but gmx mdrun was compiled without GPU support!
Pewnie muszę to sobie sam skompilować, przy okazji włączę obsługę AVX bo standardowo jest tylko SSE2.
Cytat: krzyszp w 17 Październik 2017, 21:44
Punktacja wariuje, bo jest obliczana przez serwer, który musi się "nauczyć" od hostów czasów (musi średnie sobie powyliczać). Problemem jest to, że Gromacs mocno wykorzystuje losowość i te same WU odpalone dwa razy na tym samym hoście może mieć nawet 50% rozstrzał czasu wykonywania.
Fakt, za pierwszą parę zadań dostawałem po ~500k, za kolejną było ~350k, a ostatnie dwa poszły za ~35k. Ciekawe na jakiej wartości to się w końcu ustabilizuje.
U mnie po ~ 19k sekund dało 52k. A liczyłem na 500k :P
A jak próbujesz się wstrzelić z punktacją?
Na razie w ogóle nie wstrzeliwuję się, cała para idzie w ustabilizowanie apki.
@sirzooro, nie musisz ustawiać optymalizacji jak będziesz kompilował, cmake sam znajdzie najmocniejszą dla CPU, natomiast GPU musisz podać podczas kompilacji.
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_GPU=on -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON -DGMX_BUILD_SHARED_EXE=OFF
Cytat: krzyszp w 17 Październik 2017, 23:43
Na razie w ogóle nie wstrzeliwuję się, cała para idzie w ustabilizowanie apki.
@sirzooro, nie musisz ustawiać optymalizacji jak będziesz kompilował, cmake sam znajdzie najmocniejszą dla CPU, natomiast GPU musisz podać podczas kompilacji.
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_GPU=on -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON -DGMX_BUILD_SHARED_EXE=OFF
Zostawiłem na razie tego CentOSa, zajmę się nim po zakończeniu wyścigu w PG. Na razie skompilowałem gromacsa dla ARM Mali T-628 i podpiąłem pod BOINCa :). Jak używałem domyślny plan class cuda23 to BOINC pobierał zadania ale od razu je przerywał twierdząc że nie ma odpowiedniego GPU. Po usunięciu plan_class zadania się uruchamiają, ale gmx nie potrafi otworzyć pliku wejściowego (No such file or directory) - wygląda na to że standardowy wrapper Boincowy nie wystarcza. A może jednak da się jakoś skonfigurować plik job.xml żeby go do tego zmusić?
https://boinc.drugdiscoveryathome.com/result.php?resultid=12245791
Niestety, w job.xml podaję parametr -gpu_id a wrapper wstawia nr karty do użycia... Ty nie masz tam karty (albo raczej nie masz OpenCL skompilowanego tam) i dlatego ten numer nie przejdzie...
Z ciekawostek, to miałem gdzieś Gromacsa skompilowanego dla Mali z OpenCL (Odroid C2 lub XU4, teraz nie pamiętam który), musiałbym pogrzebać, tylko... Czas na jedno WU to pewnie w tygodniach by szedł ;)
Cytat: krzyszp w 18 Październik 2017, 02:38
Niestety, w job.xml podaję parametr -gpu_id a wrapper wstawia nr karty do użycia... Ty nie masz tam karty (albo raczej nie masz OpenCL skompilowanego tam) i dlatego ten numer nie przejdzie...
Z ciekawostek, to miałem gdzieś Gromacsa skompilowanego dla Mali z OpenCL (Odroid C2 lub XU4, teraz nie pamiętam który), musiałbym pogrzebać, tylko... Czas na jedno WU to pewnie w tygodniach by szedł ;)
To jest Odroid XU4, on ma nawet dwa GPU z OpenCL 1.2 :) Choć gromacs w trakcie kompilacji wykrył tylko OpenCL 1.1, ale z tym też poszedł - wszystko się skompilowało, testy uruchomione za pomocą "make check" też przeszły.
Tutaj jest link to tej maszynki: https://boinc.drugdiscoveryathome.com/show_host_detail.php?hostid=9919
Mam XU4, wiem co to za maszynka :)
Punktacja - im większy PRZEWIDYWANY czas przeliczania, tym więcej pkt się pojawia na koncie.
Jeśli w moim wypadku, przewidywany czas był ~ godzina to pkt dawało ~ 50k, Przy przewidywanym czasie przeliczania ~ 6h punkty to 500k.
Nie do końca, zobacz na moje dwa hosty... Przeliczają WU z tej samej serii (czyli ten sam przewidywany czas), a ten z mocniejszą kartą, wykonujący szybciej WU dostaje znacznie więcej pkt.
Na razie nie mam pomysłu, co zrobić z punktacją, zwłaszcza że jak pisałem, dokładnie te same WU wykonują się w różnych czasach... A co dopiero, jak dojdą już różne WU (dla każdego WU inne dane wejściowe), gdzie będzie bardzo duży rozstrzał...
a nie można jakoś uzależnić punktacji od czasu trwania obliczeń (rzeczywistego, nie przewidywanego)? Zdaje się, że w WCG tak jest
Cytat: sknd w 18 Październik 2017, 20:20
a nie można jakoś uzależnić punktacji od czasu trwania obliczeń (rzeczywistego, nie przewidywanego)? Zdaje się, że w WCG tak jest
To bez sensu, właściciele lepszych graf by nie byli promowani...
A co wlasciwie obliczaja aktualne WU?
Faktycznie, moja teoria legła w gruzach - tylko 2 WU dostały po 500k.
Osobiście widzę stałaą punktację za WU - ww dłuższej perspetywie średnia będzie stała, zaś większy RAC będą miały osoby z lepszym sprzętem. Chyba, że kolejne batche próbek będą się znacznie od siebie różniły czasem przeliczenia.
Cytat: kva.pl w 18 Październik 2017, 21:17
A co wlasciwie obliczaja aktualne WU?
Generalnie, to teraz testujemy najnowsze metody testowania białek mogących mieć zastosowanie w medycynie (wiem, brzmi jak masło maślane, ale tak jest).
Sprawa jest dość poważna, bo już przy poprzednich testach udało się osiągnąć trafienia lepsze o 10% niż innym badaczom.
W sumie, (z tego co ja sam wiem) chodzi o znalezienie związków, które rodzą nadzieję na potencjalne lekarstwa z bazy danych setek milionów potencjalnych związków.
A na co to maja byc lekarstwa?
Cytat: kva.pl w 18 Październik 2017, 23:53
A na co to maja byc lekarstwa?
Nie tak... Tu chodzi o związki chemiczne, które mogą być podstawą do budowania białek po następne lekarstawa... Jakie? To dopiero laboratoria będą rozpracowywać, my robimy tzw. "badania podstawowe", tzn eliminujemy związki "bez szas"...
Cytat: krzyszp w 18 Październik 2017, 20:24
Cytat: sknd w 18 Październik 2017, 20:20
a nie można jakoś uzależnić punktacji od czasu trwania obliczeń (rzeczywistego, nie przewidywanego)? Zdaje się, że w WCG tak jest
To bez sensu, właściciele lepszych graf by nie byli promowani...
a jakby punktacja zależała od ilości wykonanych obliczeń? nie wiem, czy jest jakiś "licznik" ile MIPS-ów czy GIPS-ów jest wykonywanych w WU? to by było sprawiedliwe chyba
Niestety, ale chyba nie ma takiego licznika.
No dobra, ale za badania podstawowe to z tego co wiem nikt nie chce placic (poza grantami czasem), a to mial byc przeciez komercyjny projekt?
Cytat: kva.pl w 19 Październik 2017, 12:48
No dobra, ale za badania podstawowe to z tego co wiem nikt nie chce placic (poza grantami czasem), a to mial byc przeciez komercyjny projekt?
W tym przypadku myślę, że na celowniku są zlecenia z uczelni (ale ja się w to nie mieszam, więc dokładnie nie wiem).
Widze nowa wersja apki z 0.19 na 0.23. Pierwsza 0.23 czas podobny jak na 0.19 a druga po 6h ma 20% :fright:
Cytat: mimeq w 19 Październik 2017, 14:59
Widze nowa wersja apki z 0.19 na 0.23. Pierwsza 0.23 czas podobny jak na 0.19 a druga po 6h ma 20% :fright:
Czas będzie taki sam, ja manipuluję ustawieniami fpops żeby się wstrzelić w prawidłowy czas.
To jak z punktacją? Rozbieżności między czasami przeliczeń komputerów są ogromne.
Czy istnieją szanse na gpowe mielenie w najbliższych dniach? Na Nvidię nic nie mogę pobrać. Smerfnie by było zaprząc do pracy również Ati.
Na Nvidię na dniach pojawi się kilka tysięcy WU, AMD niestety na razie będzie czekać.
Projekt wciąż jest testowy czy wspomaga już naukę?
Jeśli to pierwsze to kiedy jest planowane prawdziwe liczenie?
Te kilka tysięcy WU ma być częścią większej bazy przeliczonych próbek, których jakoś nikt nigdy nie przeliczył, a są dobrą bazą pod badania.
Generalnie będzie tego dużo, ale w małych porcjach. Niestety, design bazy białek jest taki, że słabo automatyzuje się generowanie WU i w praktyce na każde kilka tysięcy WU będę musiał pisać osobny generator (mówię tu o Gromacsie).
Ok, policzylem jedno WU na GT 1050. Niezbyt mocna grafa, a obciążenie GPU było średnio 32%. To normalne i tak ma być?
Cytat: kva.pl w 29 Październik 2017, 17:28
Ok, policzylem jedno WU na GT 1050. Niezbyt mocna grafa, a obciążenie GPU było średnio 32%. To normalne i tak ma być?
Tak, to specyfika tej aplikacji, po prostu tylko część działań jest przerzucona na GPU.
Ja po prostu odpalam 2 WU naraz.
Coś się dzieje w projekcie? Czy znowu zgrzyty?
Nie, po prostu nowa apka czeka na sensowne przygotowanie zadań dla niej... Niestety, to musi trochę potrwać.
No, ja na najbliższe 150 dni mam zatrudnienie dla GPU. Wtedy mam nadzieję, że projekt ruszy pełną parą.
Taka mała reklama Boinc@Poland
(http://www.boincatpoland.org/smf/drugdiscoveryhome/drugdiscoveryhome/?action=dlattach;attach=1978)
Cytat: andy101fah w 01 Czerwiec 2018, 11:46
Taka mała reklama Boinc@Poland
(http://www.boincatpoland.org/smf/drugdiscoveryhome/drugdiscoveryhome/?action=dlattach;attach=1978)
Reklama - czy informacja?!?
Takie malutkie logo to tylko mały banerek reklamowy, każdy projekt losowo wybiera użytkownika i prezentuje go na głównej stronie, jeżeli użytkownik wypełnił profil na stronie danego projektu. Tutaj jak widzę nie wyświetla mojego profilu gdzie mam sygnaturki liczonych projektów. One są zrozumiałe w całym świecie BOINC.
http://boinc2.drugdiscoveryathome.com/
Forum puste, wszystko puste.
Coś się dzieje w temacie?