Warning: A skin using autodiscovery mechanism, boinc_poland, was found in your skins/ directory. The mechanism will be removed in MediaWiki 1.25 and the skin will no longer be recognized. See https://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Skin_autodiscovery for information how to fix this. [Called from Skin::getSkinNames in /data/www/www.boincatpoland.org/htdocs/wiki/includes/Skin.php at line 74] in /data/www/www.boincatpoland.org/htdocs/wiki/includes/debug/Debug.php on line 303

Warning: A skin using autodiscovery mechanism, fratman_enhanced, was found in your skins/ directory. The mechanism will be removed in MediaWiki 1.25 and the skin will no longer be recognized. See https://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Skin_autodiscovery for information how to fix this. [Called from Skin::getSkinNames in /data/www/www.boincatpoland.org/htdocs/wiki/includes/Skin.php at line 74] in /data/www/www.boincatpoland.org/htdocs/wiki/includes/debug/Debug.php on line 303

Strict Standards: Declaration of Skinboinc_poland::initPage() should be compatible with Skin::initPage(OutputPage $out) in /data/www/www.boincatpoland.org/htdocs/wiki/skins/boinc_poland.php on line 5
FightAIDS@Home – Wiki B@P Wspieramy naukę

FightAIDS@Home

Z Wiki B@P


Jest to podprojekt platformy World Community Grid na platformie BOINC.

  • Bardziej szczegółowy opis projektu znajduje się tutaj.


UNAIDS, Wspólny Program Narodów Zjednoczonych w sprawie HIV/AIDS, szacuje, że w 2004 r. było ponad 40 milionów ludzi na całym świecie żyjących z HIV, Ludzki wirus niedoboru odporności. Wirus ma wpływ na życie mężczyzn, kobiet i dzieci na całym świecie. Obecnie nie ma skutecznego lekarstwa, tylko leczenie różnymi lekarstwami.

Hiv pr docking.gif

Laboratorium profesora Arthura J. Olson'a w The Scripps Research Institute (TSRI) bada możliwości obliczeniowe do projektowania nowych leków anty-HIV w oparciu o strukturę molekularną. Wykazano wielokrotnie, że funkcja cząsteczki - substancji złożonej z wielu atomów - jest związana z jej trójwymiarowym kształtem. Celem Olson'a jest proteaza HIV, molekularny klucz wirusa, który zablokowany zatrzymuje dojrzewanie wirusa. Te blokery, znane jako inhibitory proteazy są więc sposobem uniknięcia wystąpienia AIDS i przedłużenia życia. Laboratorium Olson'a wykorzystuje metody obliczeniowe do identyfikacji kandydatów na nowe leki, które mają odpowiedni kształt oraz właściwości chemiczne aby zablokować proteazę HIV. Ogólna koncepcja jest nazywana "Structure-Based Drug Design", i zgodnie z National Institutes of Health's National Institute of General Medical Sciences, już ma gwałtowny wpływ na życie ludzi żyjących z AIDS.

Jeszcze większym wyzwaniem jest to, iż HIV to "niezdarny powielacz", tworzy więc stale nowe warianty, z których niektóre są odporne na aktualne lekarstwa. Konieczne jest zatem aby naukowcy kontynuowali poszukiwania nowych i lepszych leków do zwalczania tego ruchomego celu.

Naukowcy są w stanie określić, poprzez eksperyment, kształt białka oraz lekarstwa oddzielnie, ale nie zawsze oba razem. Jeśli naukowcy będą wiedzieli w jaki sposób cząsteczka leku dopasowuje się wewnątrz aktywnych miejsc docelowego białka, chemicy będą mogli zobaczyć w jaki sposób można lepiej zaprojektować leki, które mogły by być silniejsze od dzisiejszych leków.

W celu podjęcia tych działań, projekt FightAIDS@Home wykorzystuje oprogramowanie zwane AutoDock, które zostało opracowane w laboratorium Olson'a. AutoDock jest zestawem narzędzi służących do przewidywania jak małe cząsteczki, takie jak kandydaci na nowe leki, mogą wiązać się lub "dokować" do receptora znanych struktur 3D. Pierwsza wersja AutoDock została napisana w laboratorium Olson'a w 1990 roku przez Dr Davida S. Goodsell'a. Od tamtej pory nowsze wersje opracowane przez Dr M. Garrett'a Morris'a, które zostały wypuszczone wraz z nowym zrozumieniem naukowym oraz nowymi strategiami, są bardziej wydajne obliczeniowo, szybsze i łatwiejsze do wykorzystania przez innych naukowców. Od początku projektu, World Community Grid używał wersji "pre-release" AutoDock 4. W sierpniu 2007 roku, World Community Grid rozpoczął używanie nowej publicznie dostępnej wersji 4 AutoDock, która jest szybsza, dokładniejsza, może obsługiwać elastyczne docelowe cząsteczki, a więc może być również wykorzystywana do analiz białko-białko.

AutoDock jest używany w FightAIDS@Home do dokowania dużej liczby różnych małych cząsteczek do proteazy HIV, więc najlepsze cząsteczki można znaleźć obliczeniowo, wybrać i przetestować w warunkach laboratoryjnych ich skuteczność wobec wirusa HIV. Poprzez połączenie sił, Scripps Research Institute, World Community Grid oraz rosnącej liczby wolontariuszy będzie można znaleźć lepsze leki szybciej niż kiedykolwiek przedtem.

Streszczenie pierwszych wyników projektu znajduje się tutaj.

Przydatne linki

Strona główna projektu

Forum projektu

Aktualny status badań (PDF)

Personel projektu

  • Arthur J. Olson, Ph.D. Professor
  • David S. Goodsell, Ph.D. Associate Professor
  • Rik Belew, Ph.D. Professor and Chairman of Cognitive Science
  • Garrett M. Morris, D. Phil., Staff Scientist
  • William Lindstrom, Ph.D. Postdoctoral Research Fellow
  • Alexandre Gillet, Computer System Administrator
  • Max Chang, Bioinformatics Graduate Student (with R. Belew)

Oprócz wymienionych osób, w projekt zaangażowanych jest wiele ośrodków badawczych i laboratoriów. Można o nich przeczytać tutaj.